微生物16s宏基因组学原理与技术培训班

发布时间:2016-05-27 13:59:35

2016年5月,美国发起“国家微生物组计划”,共计投入5.21亿美元,这是奥巴马政府继“精准医学计划”后提出的又一个大科学计划。一石激起千层浪,此举在全世界引发微生物组研究的热潮。在中国,科学家们正向国家大力呼吁中国微生物组计划研究,力争将其列入国家重点研发任务,5年应该要投入5-10个亿人民币左右的经费。

微生物组的主要原理与技术是宏基因组学。近几年,微生物宏基因组学研究在学术界受到重视,多篇论文发表在Nature, Cell, Nature Medicine, Nature Communications等国际一流学术期刊。在这方面,华大基因与中南大学做了很好的工作。例如,华大基因的肠道微生物与2型糖尿病方面的论文发表在Nature (2012)。微生物宏基因组学的原理与技术,特别是微生物16s宏基因组学, 已经运用到健康、污染防护、土壤与地质、食品安全、农业等各领域,为促进科学发展做出了卓越的贡献。

为普及微生物16s宏基因组学的原理与技术,促进科技进步,赢润生物集团联合中南大学、华大基因的一流专家,面向全国开展微生物16s宏基因组学培训。只要您有一台普通的办公电脑,通过我们的培训,您就能独立进行微生物16s宏基因组学的生物信息学分析,摆脱对生物信息分析师的依赖,论文发表如虎添翼。本培训适用于医学、农学、食品、环保、矿业、海洋等一切与微生物有关的专业。

快来报名参与学习吧!您也可以成为大数据分析与基因组学高手!

样品间OUT差异venn图

样品间物种差异柱状图

组间物种差异Heatmap

样品中物种系统进化树

一、培训时间

2016年7月22日-24日(共三天)

二、培训地点

湖南省赢通基因与细胞工程技术研究中心(长沙市岳麓区银盆南路317号4楼)

三、培训对象

从事医学、农学、食品、环保、矿业、海洋等与微生物相关领域的科研工作者、高校教师及研究生

四、培训方式

理论讲授和上机操作紧密结合。

课程安排

时间 内容
7月22日 上午 理论① 高通量测序技术及在微生物16s宏基因组学中的应用② Linux的基础命令③ 利用Qiime进行OUT聚类分析与注释,绘制Venn图和Heatmap图
下午 上机
7月23日 上午 理论① 利用Qiime进行Alpha-多样性分析,Beta-多样性分析与PCA分析② 差异OTU分析③ Megan5构建系统进化树 
下午 上机
7月24日  上午 ① usearch OTU聚类,RDP classifer进行OTU物种注释② 使用mothur进行alpha多样性分析③ 使用metastats进行组间差异分析④ 使用R语言画常见的柱形图、热图
下午 上机

注意事项:为保证培训质量,请自带笔记本电脑(需8G或以上内存),安装windows 64位操作系统。

六、师资简介

朱飞舟:

2007年博士毕业于中南大学医学遗传学国家重点实验室,现任中南大学生命科学学院副教授,硕士生导师。全国素质教育模范教师,全国素质教育师德标兵,湖南省卫生经济与信息学会生物医学信息专业委员会委员。研究方向为医学基因检测与基因工程。承担国家、省、市级多个项目。国家发明专利2项。论文发表在 “Molecular Genetics, Microbiology and Virology”,Progress in Biochemistry and Biophysics, Chinese Science Bulletin, International Journal of Clinical and Experimental Medicine (submitted) 等。

钟慧:

2007年博士毕业于中南大学,2008-2010 加拿大卡尔加里大学博士后,现任中南大学生命科学学院副教授,硕士生导师。从事环境微生物以及医用材料方面的研究,主持国家自然科学基金青年基金项目1项,湖南省博士后基金1项、中央高校青年教师助推基金1项。作为课题组成员参与承担国家“863”、国家自然科学基金面上项目等课题的研究。作为主要成员于2015年获江西省自然科学奖一项。在Hydrometallurgy, “Water, Air, & Soil Pollution”, Bioresour Technol,Biochem Biophys Res Commun等SCI杂志发表论文多篇。

陈建威:

华大基因生物信息分析工程师。熟悉Linux工作环境;熟悉perl语言编程,可撰写流程;对微生物、Meta、RNA、表观等产品及分析流程方法熟悉;论文发表在Front. Microbiol,Sci. Rep,Microb Ecol,Infect Dis Transl Med,PLoS ONE,J Biotechnol等。

七、培训费用

4800 元。费用包括:培训资料、教学。

户  名:湖南省赢通基因与细胞工程技术研究中心

开户银行:中国工商银行长沙岳麓山支行

账  号:1901 0272 0920 1045 114

联系方式

报名联系人:吴双

咨询电话:0731-84318725

QQ:1670829912

电子邮件:yrbio.com@gmail.com

会议时间2016-07-22至2016-07-24
会议地点湖南长沙
主办单位赢润生物
联系人吴双
电话0731-84318725
Emailyrbio.com@gmail.com
会议规模31-50人
官方网址http://www.yrbio.com/node/5193

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