生物信息数据处理与Perl语言编程应用专题培训班

发布时间:2017-05-17 15:46:38

生物信息数据处理与Perl语言编程应用专题培训班

Perl语言作为绝大多数生物信息学工作者首选语言之一。北京市计算中心生物计算事业部针对没有任何计算机语言的生物学、医学、农学等人员,且有从事生物信息学工作相关研究工作的需要。欢迎您报名参加!

举办地:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
培训时间2017年6月26日-28日 (报名中)上午9:30-12:00,下午13:30-17:00
培训内容及安排:

日期

授课题目

授课内容

第一天

概述

1.    生物信息学数据处理概述;

2.    Perl语言简介特点与数据处理的优势与应用范围

运行调试

3.    Perl语言解释器、编辑器安装;

4.    Perl运行环境测试与程序编写;

5.    UltraEdit软件应用与生物信息学数据文件处理;

6.    基于宏的perl语言快速编程

操作基础

7.    Perl语言基本变量、操作符、判断结构;循环结构;

8.    Perl语言常用函数的功能应用;

9.    生物学数据文件的读入与输出;

10.  生物信息学常见文件的分割、合并、过滤、信息提取等;

11.  批量自动化数据文件操作

第二天

生物信息实例应用

12.  常用生物信息学数据文件格式简介;

13.  perlNCBIENA等数据库批量下载基因序列;

14.  perl进行生物学数据文件格式转化;

15.  perl编程从FastaGBKFastqPDB等提取关键生物学数据信息;

16.  perl批量自动化下载基因序列;

17.  perl进行DNAprotein批量翻译;

18.  perl批量DNA序列反向互补;

高级数据处理

19.  Perl语言的数组、二维数组、hash表用法;

20.  perl自动化从表格数据提取信息;

21.  矩阵数据文件的生成与应用

22.  二代测序NGSGWAS等生物信息分析中perl的应用

第三天

模块与子程序

23.  perl子程序与模块应用;

24.  强大的正则表达式的应用;

25.  perl进行基因ID列表比较、筛选与统计;

Perl的高级应用

26.  Perl第三方代码库CPAN的简介与应用;

27.  Bioperl模块与应用;

28.  常用生物信息学程序实例;

29.  perl进行批量自动化本地blast比对及数据分析;

30.  基于perlcircos基因组作图工具介绍;

(此表仅供参考,授课内容以实际授课为准)
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
培训特色
1、对口生物信息;    2、非严格语法,适合初学;
3、功能强大、跨平台;4、有巨大的第三方代码库CPAN

报名费用  注册费:3000元/人(含听课费、资料费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用),主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。
付费方式现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心      账号:0200151819100023937 
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”)
报名优惠政策
1、5.20日前报名缴费,可享受减免200元优惠;
2、3人以上团体报名每人可减少400元;
3、4+1团报,可免费赠送一个名额                
4、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。
联系咨询
QQ号:2814500767
于老师   010-59341771,15600660904,邮箱:yurt@bcc.ac.cn
 

会议时间2017-06-26至2017-06-28
会议地点北京海淀区
主办单位北京市计算中心生物计算事业部
联系人员老师
电话010-59341773
Emailyuanll@bcc.ac.cn

声明:

1.以上会议非科学网主办或承办会议,科学网会议频道会议来自于互联网方便用户了解行业信息,如需参会、汇款、获取邀请函或会议日程,请与主办单位联系
2.部分会议信息来自互联网,由于网络的不确定性,科学网对所发布的信息不承担真实性的鉴别工作,请谨慎选择汇款参会,若您发现信息有误,请联系010-62580809纠错
3.更多服务信息请点击这里
推荐会议