2015.8.2-8.5日 Perl 语言与生物信息学应用

发布时间:2015-05-29 14:22:20

 
 

Perl语言基础与生物信息学应用讲习班   

 
 
 

   

 
 
 
Perl语言作为绝大多数生物信息学工作者首选语言之一。北京市计算中心生物计算事业部针对没有任何计算机语言的生物学、医学、农学等人员,且有从事生物信息学工作相关研究工作的需要。欢迎您报名参加!  
 
主办单位:北京市计算中心,生物计算事业部  
 
举办地:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼  
 
培训时间第九期201582-5日 (报名中)  
 

培训内容及安排:   

 
 
 
  
 

日期   

 
 
 

时间   

 
 
 

授课题目   

 
 
 

授课内容   

 
 
 

第一天   

 
 
 

09:30-10:00  

 
 
 

生物信息学与Perl语言概述   

 
 
 

概括介绍生物信息学背景与Perl语言的概念及特点   

 
 
 

10:00-10:20  

 
 
 

软件安装与运行环境调试   

 
 
 

Perl语言解释器、编辑器安装,Perl程序运行测试   

 
 
 

10:20-12:00  

 
 
 

基本操作与基本概念   

 
 
 

DOSUnix命令行操作基本命令;Perl语言基本变量与操作符;基本变量、字符串赋值、基本运算等   

 
 
 

13:30-16:30  

 
 
 

基本语法结构、文件与文件夹操作   

 
 
 

判断结构;循环结构;文件的读入与输出;文件夹操作   

 
 
 

第二天   

 
 
 

09:30-12:00  

 
 
 

数组、二维数组、hash表及应用   

 
 
 

数组的概念及用法;   

 
 

二维数组概念与应用;   

 
 
 

关联数组(hash)的用法;   

 
 
 
 

13:30-16:30  

 
 
 

函数、子程序、正则表达式   

 
 
 

常用函数学习;   

 
 

子程序概念与应用;   

 
 
 

正则表达式的应用;   

 
 
 
 

第三天   

 
 
 

09:30-11:00  

 
 
 

生物信息学Perl程序实例与应用   

 
 
 

常用生物信息学数据库及专业软件应用简介;   

 
 

二代测序数据分析;   

 
 
 

生物信息学实用程序;   

 
 
 
 

11:00-12:00  

 
 
 

CAPNBioperl简介、Bioperl的安装   

 
 
 

Perl模块安装、包与引用简介;   

 
 

Perl第三方代码库CPAN的简介与应用;   

 
 
 

Bioperl简介与安装;   

 
 
 
 

13:30-16:30  

 
 
 

Bioperl的基本应用   

 
 
 

文件读取与格式转换;   

 
 

生物学数据自动化批量下载;   

 
 
 

序列信息统计与分析   

 
 
 
 

第四天   

 
 
 

09:30-12:00  

 
 
 

Bioperl应用进阶学习   

 
 
 

GenBank基因组文件特定信息提取;   

 
 

序列自动化比对;   

 
 
 

进化距离计算;   

 
 
 
 

13:30-16:00  

 
 
 

数据可视化与做图等   

 
 
 

Perl语言做图;   

 
 

基因组信息图形化展示;   

 
 
 

Perl的外界调用与整合应用;   

 
 
 

Perl面向对向编程序   

 
 
 
 
  
 

(此表仅供参考,授课内容以实际授课为准)   

 
 
 

注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。   

 
 
 
培训特色  
 
  
 
1、对口生物信息;    2、非严格语法,适合初学;  
 
3、功能强大、跨平台;4、有巨大的第三方代码库CPAN 
 
  
 

报名费用  注册费:3000/人(含听课费、资料费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用),主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。   

 
 
 

付费方式现金、支票、银行转账、银行汇款   

 
 
 

单位全称:北京市计算中心      账号:0200151819100023937   

 
 
 

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行   

 
 
 

(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”)   

 
 
 
报名优惠政策  
 

12015710日前报名缴费,可享受减免400元优惠   

 
 
 

   23人以上团体报名每人可减少400元;   

 
 
 

   34+1团报,可免费赠送一个名额                   

 
 
 

   4、上面3种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。   

 
 
 

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。   

 
 
 

联系咨询   

 
 
 
张利英 010-59341771 ,18618295767QQ号:2814500767,邮箱:zhangly@bcc.ac.cn  
 

员丽丽 010-59341773, 18701529461 ,  邮箱:yuanll@bcc.ac.cn   

 
 
 
  
 

报名回执表:  

 
 
 

培训班类型:(可多选)   

 
 
 

□实用生物信息学培训班  □论文发表所需的图表处理实用技能   

 
 

生物信息与宏基因组分析专题研讨班    Perl语言专题班   

 
 
 

□实用生物信息技术及应用(罗静初教授主讲)   

 
 
 
 

姓名:   

 
 
 

   

 
 
 

性别   

 
 
 

   

 
 
 

民族:   

 
 
 

   

 
 
 

职称:   

 
 
 
  
 
 

身份证号   

 
 
 

   

 
 
 

工作单位:   

 
 
 
  
 
 

住宿:   

 
 
 

是□;否□   

 
 
 

研究方向:   

 
 
 

   

 
 
 

报名时间:   

 
 
 

   

 
 
 

通讯地址:   

 
 
 
  
 
 

邮编:   

 
 
 
  
 
 

固定电话:   

 
 
 
  
 
 

手机   

 
 
 
  
 
 

E-mail:  

 
 
 
  
 
 

报名种类:   

 
 
 

A           B           (该选项仅报名生物信息培训班人员填写)   

 
 
 

对课程了解情况   

 
 
 

☆☆☆☆☆   

 
 
 

感兴趣的课程:   

 
 
 

   

 
 
 
信息渠道:  
 
 
□中心主页 □邮件宣传(张利英、员丽丽)□海报 □单页 □销售员  □丁香园  □生物论坛  □生物通邮件、主页  □朋友推荐                 
 
 
发票抬头:  
 
 
  
 
 

发票内容:   

 
 
 
  
 
 
住宿明细  
 
 
入住时间:  
 
离店时间:  
 
 

房间类型   

 
 
 
□大床间  
 
□标准间(和       合住)  
 
□拼房(与其他学员拼标准间)  
 
 

备注:   

 
 
 

   

 
 
 
                                   

确定报名后,请将回执表发到上述联系人邮箱里。如在两日内没有收到回复,请电话联系确认。   

 
 
 
  
 
  
 
 

会议时间2015-08-02至2015-08-05
会议地点北京海淀区
主办单位北京市计算中心(生物计算事业部)
联系人员老师
电话010-59341773
Emailyuanll@bcc.ac.cn
会议规模11-30人
官方网址http://bioc.bcc.ac.cn/bcc/China/shengwuxinxipeixun/2014-07-18/59.html

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