第一期分子进化分析培训班---春季培训开始接受报名,本期讲座的主要内容以实际案例上机为主,讲解各种分子进化数据的实用分析和图表绘制方法。特邀讲师包括SCI杂志审稿人在内,在分子进化方向皆具备欧美十余年的科研项目经验,任职于复旦大学和华东师范大学。
第二期组学数据功能分析培训班---春季培训开始接受报名,本期讲座以实际案例上机为主,讲解各种组学数据的相互比较,功能分析的实用分析和图表绘制方法。特邀讲师包括SCI杂志审稿人在内,在生物信息及分子动力方向皆具备欧美十余年的科研项目经验,任职于复旦大学和华东师范大学。培训旨在通过实践学习多种组学数据的分析方法,解读生物学意义以及SCI论文释疑。
承办单位
金弗康生物科技(上海)有限公司
时间、地点
培训时间:第一期分子进化分析培训班:2015年4月9日(周四)至4月11日(周六);
第二期组学数据功能分析培训班:2015年4月16日(周四)至4月18日(周六)
培训地点:上海格林豪泰大酒店(沈杜公路店)
报名链接:http://www.geneforhealth.com/col.jsp?id=116
分子进化分析培训班(4月9-11日)
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日期
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时间
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授课题目
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授课内容
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4月9日(周四)
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08:30-09:30
1h
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报到
开班仪式
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安装软件
测试网络
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09:30-11:30
2h
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分子进化/生物信息分析内容/套路的详解
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以SCI文章为例,具体学习分子进化研究中流行的分析思路和方法
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13:00-15:00
2h
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主流数据库使用
上机实践
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重点学习在NCBI,UNIPROT,ENSEMBL网站中获取数据的方法和途径
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15:00-17:30
2.5h
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同源家族成员查找
上机实践
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重点学习如何在数据库中查找已知序列的同源信息和数据的获取。
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4月10日(周五)
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09:30-11:30
2h
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同源家族成员比较分析
上机实践
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在获取同源家族成员后进行相互比较,分析保守区域,获取重要功能位点,绘制sequence logo图。
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13:00-17:00
4h
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分子进化树构建
上机实践
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学习分子进化树构建原理,MEGA软件的使用,对进化树的解读
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17:00-17:30
0.5h
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总结答疑
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4月11日(周六)
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9:30-11:30
2h
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基因功能注释
上机实践
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学习GO,KEGG分析,绘制饼图,柱状图,通路图
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13:00-15:00
2h
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蛋白2D结构分析
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信号肽,跨膜结构分析,二级结构预测,结构域分析
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15:00-17:00
2h
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蛋白3D结构分析
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PDB数据库学习,3D结构模拟,绘图
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17:00-17:30
0.5h
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总结答疑
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第二期组学数据功能分析培训班(4月16 – 18号)
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日期
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时间
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授课题目
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授课内容
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日期
4月16日(周四)
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08:30-09:30
1h
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报到
开班仪式
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安装软件
测试网络
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9:30-11:30
2h
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组学数据格式
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1. 转录组学数据格式
2. 蛋白组学数据格式
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13:00-14:00
1h
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物种数据获取
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重点学习在NCBI,UNIPROT,ENSEMBL网站中获取数据的方法和途径
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14:00-16:30
2.5h
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数据准备
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1. 归一化
2. PCA分析
3. 聚类分析
4. 差异数据筛选
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16:30-17:30
1h
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SCI从撰写到投稿
由SCI杂志审稿人主讲
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SCI论文写作技巧,投稿和回复审稿人意见
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日期
4月17日(周五)
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单组数据分析
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9:30-11:30
2h
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GO富集分析
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学习GO数据结构,分析方法,绘制发表格式图片
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13:00-15:00
2h
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KEGG信号通路富集分析
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学习KEGG数据库的使用,学习解读KEGG信号通路图
绘制图片
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15:00-16:30
1.5h
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蛋白互作分析
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学习蛋白互作数据库STRING的使用,数据获取
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16:30-17:30
1h
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共表达分析
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学习计算pearson相关性,分析,聚类和绘图
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日期
4月18日(周六)
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多组数据分析
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包括多种处理,多个时间点
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9:30-11:30
2h
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调控网络模型构建
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1. 学习使用cytoscape进行简单模型构建
2. 学习在模型中整合富集结果(BP/KEGG)信息
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13:00-15:00
2h
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多组数据联合分析
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学习使用韦恩对数据进行分组并绘图
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15:00-16:30
1.5h
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根据需要进行子集合并,再进行富集分析
合并子网络进行复杂调控模型构建
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16:30-17:30
1h
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答疑
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