一、培训特色:
主题明确,针对性强,理论和实践结合,主讲与学员研讨的方式进行;
授课专家拥有丰富的表观遗传学数据分析和项目执行经验;
课下主讲老师为您所遇到的问题提供个性化解答;
配合研究中所需的要点,围绕实际研究中常用的软件展开;
学员通过与专家直接交流,能够分享到顶尖学术机构的研究经验和实验设计思路。
培训内容
一、表观遗传学研究现状及未来发展
二、表观遗传学相关的数据库介绍与使用
三、高通量测序技术概述
四、常用生物数据文件类型介绍与格式转换
五、代测序数据质控、比对分析与可视化
六、常用在线工具和数据库使用操作
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一、DNA甲基化原理、应用及研究方法、微生物基因组
1甲基化特异性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP)
2亚硫酸氢盐测序法(Bisulfite sequencing PCR,BSP)
3 高分辨率熔解曲线法(High Resolution Melting,HRM)
4.比较各项甲基化研究方法存在的优缺点等
二、DNA甲基化数据分析策略
1 WGBS分析:利用fastqc和perl脚本对原始数据进行质控
2 之后用bismark进行mapping和beta值计算
3 R的methylKit包筛选差异甲基化位点并用pheatmap包和ggplot2包进行可视化
4.PeakAnnotator对 这些位点进行功能域和基因注释,最后用DAVID进行GO和 KEGG 通路注释
DNA甲基化调控案例讲解
DNA甲基化测序数据分析上机实战
三、DNA甲基化芯片数据分析上机实战
1芯片DNA甲基化分析
2利用R的IMA包进行差异甲基化位点鉴定并用pheatmap包和ggplot2包进行可 视化, 用DAVID进行GO和KEGG通路注释
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一、染色质可及性测序技术
二、组蛋白修饰原理与分子功能
三、组蛋白修饰功能
四、核小体定位图谱分析实战练习
五、组蛋白修饰数据分析实战练习一
六、组蛋白修饰数据分析实战练习二
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一、还原真实染色,质构象--HiC技术
二、TCGA与ICGC,数据库介绍与使用
三、干细胞的表观遗传学研究
四、转录因子ChIP-seq数据分析
五、生存曲线分析
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非编码RNA研究及数据分析
1. miRNA研究的综合解决方案;
2. miRNA研究的数据分析(芯片、测序);
3. lncRNA研究的综合解决方案;
4. lncRNA研究的数据分析(芯片、测序);
5. Agilent相关技术在非编码RNA研究中的应用。
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报名办法及费用:
每人¥3900元(含报名费、培训费、资料费等相关费用),不含食宿费用,食宿可统一安排,费用自理。
联系方式:
联系人:张爱国
联系电话:136 8311 1214
座机:010-58032788
报名邮箱:zky_im@vip.126.com
参会报名表.docx
会议时间 | 2017-11-24至2017-11-27 |
会议地点 | 重庆巴南区 |
主办单位 | 中科云畅应用技术研究院 |
联系人 | 张爱国 |
电话 | 13683111214 |
Email | 3173746463@qq.com |
会议规模 | 11-30人 |
声明:
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