“工欲善其事,必先利其器”,对于从事生物信息学研究,软件和工具绝对是必不可少的。您对生物信息学常用的软件和工具可能进行过简单的了解和使用,但您可能在使用的过程中会遇到各种各样的疑问,如面对众多的生物信息学分析软件却不知该如何选择应用?对于软件繁杂的使用方法和众多参数不知如何取舍?为了解决您遇到的困扰,打开您的思绪,北京市计算中心生物计算事业部举办《生物信息学软件与工具使用培训班》。介绍生物信息学研究及数据分析中所用的各种数据库使用,通过实际项目演练,学习常用分析软件的使用方法,将课程各项知识点融会贯通,从而使学员深刻理解并掌握生物信息学数据库和工具使用的要点。大家赶快一起来交流探讨吧!一流的学员和经验丰富的老师在这里等着你的到来!
授课对象: 全国生命科学、基础医学、农林科学等领域大专院校、科研机构、公司企业从事分子生物学、生物化学、遗传学、基因组学等研究、开发和教学的第一线研发人员和青年教师、博士后和研究生。
主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:北京市计算中心
协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
培训地点:北京海淀区丰贤中路7号3号楼,北京市计算中心三层会议室
本次课程时间: 2017.9.26-9.29 上午:9:30 - 12:00 下午:1:30 – 5:00
日期
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时间
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课程名称
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课程内容
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第一天
上午
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09:30-10:30
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生物信息学概述与前沿
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1. 基因组学与生物信息学背景知识介绍;
2. 生物信息进展与前沿技术介绍;
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10:30-12:00
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NCBI数据库
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1. NCBI数据库介绍:PubMed、Nucleotide(GenBank)、Genome、Structures(MMDB)、Taxonomy、UniGene、Entrez等,数据查询检索;
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第一天
下午
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13:30-15:00
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NCBI数据库
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2. NCBI数据库数据上传提交与批量下载;
3. NCBI数据库实例讲解与练习;
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15:00-17:00
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Blast与序列比对
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1. Blast与序列检索比对及参数;
2. Blast建库与Blast本地化;
3. 实例讲解与练习;
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第二天
上午
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09:30-12:00
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MEGA软件与分子进化
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1. 分子进化理论基础;
2. MEGA与系统发育树构建;
3. 实例讲解与练习;
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第二天
下午
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13:30-17:00
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基因组注释
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1. 基因本体数据库GO及GO注释;
2. 生物学通路KEGG注释方法与实现;
3. David与基因注释;
4. IPA简介,查询搜索,通路分析与网络构建;
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第三天
上午
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09:30-12:00
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分子网络与生物学通路分析
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1. 分子相互作用数据库与通路概述(Uniprot,String,DIP数据库);
2. 分子网络分析工具Cytoscape及插件使用;
3. 实例讲解与练习;
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第三天
下午
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13:30-15:30
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疾病和基因突变数据库
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1. GeneCard数据库介绍及使用;
2. HGMD(人类基因突变数据库)数据库介绍及使用;
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15:30-17:00
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药物基因组数据库
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1. PharmGKB数据库介绍及使用;
2. PGMD数据库介绍及使用;
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第四天
上午
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09:30-12:00
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表观遗传学
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1. Encode数据库介绍及使用;
2. Roadmap数据库介绍及使用;
3. RegulomeDB数据库介绍及使用;
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第四天
下午
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13:30-15:30
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蛋白质3D结构
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1. 蛋白质结构分析概述;
2. PDB数据库介绍与使用;
3. PyMol蛋白质结构分析软件介绍与使用;
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15:30-17:00
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SPSS软件与生物统计应用
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1. 生物统计概述;
2. SPSS使用与生物统计应用;
3. 实例讲解与练习;
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(课程内容以实际授课为准)
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
【报名费用】培训费3800元/人,含听课费、资料费、上机费,请自带笔记本电脑用以上机实习。材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社;近最近酒店为:如家酒店(永丰店),可自行网上预定,食宿自理。
【报名优惠政策】
1、8.10日报名缴费可优惠300元。
2、3人以上团体报名每人可减少300元;
3、4+1团报,可免费赠送一个名额
上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。
【付费方式】现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心 账 号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(备注:在汇款明细里加上“生物计算事业部——您的姓名+单位”)
【联系咨询】 QQ号:2814500767;于老师 010-59341771 邮箱:yurt@bcc.ac.cn
会议时间 | 2017-09-26至2017-09-26 |
会议地点 | 北京 |
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