基因组遗传变异与数据分析实用技术培训班

发布时间:2017-04-27 15:06:16

 

随着深度测序技术的发展与成熟,产生了海量的基因组的数据,通过全基因组重测序的序列比对,研究者可以找到大量的单核苷酸多态性位点(SNP)、拷贝数变异(CNV)、插入缺失(InDel)、结构变异(SV)等变异位点。并通过对已知全基因组序列的物种进行测序,来研究个体或群体间的相关变异信息,从而找出与疾病、性状、以及功能有关的基因,进行个体或群体分子水平的差异分析。随着测序成本的大幅度降低以及测序效率的数量级提升,再加上已知基因组序列的物种增多,全基因组重测序已成为动植物物种遗传差异研究、功能基因挖掘等最可靠的方法。北京市计算中心举办《基因组遗传变异与数据分析实用技术培训班》,目的就是为统计遗传学领域的专家学者、计算系统生物学家、从事复杂疾病遗传易感性研究的专业人员、生物信息科学工作者、研究生提供一个互相交流的平台,并为今后的项目交流和相互合作创造条件。 

主办单位: 中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:北京市计算中心
协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
培训地点:北京海淀区丰贤中路73号楼,北京市计算中心三层会议室
本次课程时间: 2017.6.13-6.15(报名中) 
上课时间:上午:930 - 1200  下午:130 – 500


日期

时间

授课题目

授课内容

第一天

上午

生物信息学概述及NGS原理与应用

1. 生物信息学知识背景概述;

2. 二代测序(NGS)的基本概况和技术发展简介;

3. NGS建库原理与技术;

下午

Linux上机操作及生物信息学软件安装及使用
(上机操作)

1. linux基础与基本操作;

2. 生物信息学软件应用及常用软件介绍;

3. 重测序相关分析软件介绍及安装;

第二天

上午

基因组重测序技术应用理论与策略

1. 基因组重测序的理论与研究方法及意义;

2. 全基因组数据分析策略;

3. 全外显子数据分析方法与应用;

4. 目标区域测序的策略应用与技术前沿应用;

下午

基因组变异分析
(上机操作)

1. 重测序的分析流程;

2. 原始测序数据的质控及过滤;

3. 学习BWAsamtools等工具的使用,进行calling SNP,INDEL

4. sam/bam文件处理、VCF文件与基因组变异位点分析

第三天

上午

基因组变异分析
(上机操作)

1. 利用重测序数据检测拷贝数变异(CNV);

2. 利用重测序数据检测易位、转置等结构变异(SV

下午

基因组变异注释与功能分析
(上机操作)

1. 基因组注释工具Annovar的应用;

2. 功能分析工具David的使用;

3. 基因组变异数据库GenecardHGMD等以及功能分析的应用;

4. 药物基因组学与靶向药突变位点查询;

5. 基因组变异位点筛选与过滤分析

(课程内容以实际授课为准)
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
【报名费用】 
注册费3500元,含听课费、资料费、上机费和午餐。请自带笔记本电脑用以上机实习。
【报名优惠政策】 
15.20日报名缴费可优惠300元。
23人以上团体报名每人可减少300元;
34+1团报,可免费赠送一个名额
上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。 
【付费方式】现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心
    号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(备注:在汇款明细里加上生物计算事业部——您的姓名+单位 
 【联系咨询】 QQ号:2814500767
于老师   010-5934177115600660904  邮箱:yurt@bcc.ac.cn
员老师   010-59341773,邮箱:yuanll@bcc.ac.cn

会议时间2017-06-13至2017-06-15
会议地点北京

声明:

1.科学网会议频道仅负责发布会议信息,如需参会、汇款、获取邀请函或会议日程,请与主办单位联系
2.部分会议信息来自互联网,由于网络的不确定性,科学网对所发布的信息不承担真实性的鉴别工作,请谨慎选择汇款参会,若您发现信息有误,请联系010-62580811纠错
3.更多服务信息请点击这里
网友评论
以下网友留言只代表网友个人观点,不代表网站观点
  昵称: --注:登录后才可进行评论--
 
  验证码:
推荐会议