2017~LAMMPS分子动力学模拟暑期研修班
各企事业单位:
分子模拟在现代科学技术研究开发中发挥着重要的作用,一方面,它能从本质上定量化探索机理和规律,另一方面,又能促进我们的研究开发工作向经济、高效和有预见性的方向发展。近年来,分子动力学计算模拟,发展和普及得异常迅速,出现多款功能强大的计算模拟软件,如 LAMMPS 全称是“大规模原子分子并行模拟器”主要用于分子动力学相关的一些计算和模拟工作。LAMMPS 可以支持包括气态,液态或者固态相形态下、各种系综下、百万级的原子分子体系,并提供支持多种势函数,且 LAMMPS 有良好的并行扩展性。为普及分子动力学计算软件 LAMMPS 的使用,培养高素质的分子模拟专业人才,应广大单位和科研院所要求,郑州晟智科信企业管理咨询有限公司特举办“2017-LAMMPS分子动力学模拟暑期应用技术”会议。现将有关事宜通知如下。
一、时间地点:
2017年 6月8日---6月11日 北京科技大学
(时间安排:第一天报到 ,授课三天)
二、学习目标:
本次学习本着“理论实践并重、学以致用”的目的,采用深入浅出的方法,先从分子动力学模拟的基本原理出发, 结合简单案例引导学员入门,通过实例参考了解解决实际问题的途径与软件操作,随后紧密结合应用实例, 针对模拟中存在的疑难问题进行分析讲解和专题讨论,有效提升学员解决复杂模拟建模与分析的能力, 从而更好地满足学员不同方面的科研需求. 参加此学习后学员将可以马上上手研究实际问题。
三、授课方式:
1、理论课程讲解; 2、上机操作; 3、专题小组研讨与案例讲解分析结合
(主题明确,针对性强!欢迎学员带着自己在工作中遇到的实际问题与老师一起探讨)
四、报名费用:
RMB: 2800元(报名费、资料费、上机费、午餐费、授课费等)食宿可统一安排,费用自理。
注:5月20前报名注册人员优惠200元;
五、报名方式:
请各单位接此通知后,尽快确定参会人员,认真填写报名回执并传真至:0371-86073066或发E-mail至: szkxhwz@126.com ,会务组收到回执后将通知相关报到事宜。并于会前一周发送报到通知(详细上课地点及乘车路线)!
课程大纲
第一天
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8:30-11:30
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作为科学研究手段的分子模拟:历史与展望
分子模拟的优势和局限:几个案例
分子模拟的基本框架:建模(前处理)/采样(模拟)/分析(后处理)
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13:30:17:00
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MD基本原理:运动方程/边界/截断/长程作用/系综...
模拟数据分析基础:微观结构/热力学性质/时间相关函数
分子力场参数优化举例
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第二天
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8:30-11:30
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LAMMPS上机实战 1
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用 LAMMPS操作完成Lennard-Jones melt, crack 两个问题的分子动力学模拟,并将结果利用VMD、OVITO软件进行可视化。学员在此阶段可以学习LAMMPS in文件的编写及可视化软件VMD,OVITO的使用,制作精美图片、动画。通过几个练习,学员亲自上机实践,加深对lammps关键命令的理解。
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13:30-17:00
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LAMMPS上机实战 2
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学习data文件的结构以及编写方法和注意事项, 学习用VMD、Moltemplate、MS软件来建立涉及水、碳管、石墨烯、高分子链等的初始构型,并导出lammps能用的data文件的方法。通过具体的练习,亲自操作,加深学员对于这些软件、方法的掌握。
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第三天
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8:30-11:30
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LAMMPS上机实战 3
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利用LAMMPS完成melt, crack问题的研究,并分析模拟所得结果。运用lammps对系统施加不同载荷、控温、控压等操作的实现;如何在lammps模拟中输出后续分析所需要的系统不同层次的信息;进一步讲解VMD、OVITO在模拟结果分析中的作用。通过具体的练习来加深学员对lammps施加不同载荷的命令的理解。
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13:30-17:00
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LAMMPS上机实战 4
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全原子分子动力学模拟、粗粒化分子动力学模拟实例讲解。通过多个实例的演示学习,加强学员对lammps模拟中主要文件的编写、系统平衡、时间步长选择、出错调试等等一系列重要问题的认识。
答疑解惑,互动讨论。
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联系我们:
会务组:许老师 电话:0371-86073066 E-mail:szkxhwz@126.com
会议时间 | 2017-06-08至2017-06-11 |
会议地点 | 北京海淀区 |
主办单位 | 郑州晟智科信企业管理咨询有限公司 |
联系人 | 许老师 |
电话 | 0371-86073066 |
Email | szkxhwz@126.com |
会议规模 | 11-30人 |
声明:
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