IPA应用与数据分析培训班 第二轮通知

发布时间:2015-11-19 10:47:27

  生物信息学分析实战演练

l  直接上机操作,手把手快速入门生物信息学分析

l  有效挖掘显著差异基因/蛋白的生物学含义

l  针对自有芯片数据,做生物通路富集分析,得到属于自己试验结果的生物通路网络

l  对比不同实验组的大数据,获得独一无二的差异表达结果

l  查询差异基因/蛋白的生物功能,寻找相关调控因子,直接靶向定位

l  规避数据中假阳性/假阴性数据,获得有效的生物学结果

 

主办单位:北京市计算中心生物计算事业部

源资信息科技(上海)有限公司  

培训时间: 20151210-12  (火热报名中)

培训地点:北京市计算中心三层会议室 (北京海淀区丰贤中路73号楼)

 

    随着基因组序列测定的费用越来越低,收集一个人遗传信息的速度也越来越快,我们能够更好地检测预防疾病、个性化定制药物疗法,并对海量的医学研究数据进行个性化处理。这种技术上的进步会让大部分人长期保持健康,同时这种基因图谱和分析技术是一种新兴的医学专业,世人称之为“精准医疗”。

“精准医疗”时代的来临和大数据的爆发,如何有效利用大数据技术将队列数据、临床数据、组学数据、结构生物学数据、药物分子信息等数据进行挖掘和处理,通过生物信息学的手段发现新靶点、新结构、新药物、新方案、新标准和新规范是目前的首要任务。

Ingenuity Pathway Analysis (IPA) 基于后台高度结构化的Ingenuity Knowledge Base知识库,包括人工阅读提取的几百万条公开发表的科研成果和报告,可用于分析、整合、理解来自于基因表达,microRNASNPRNA-SeqSNP-Genotyping微阵列的数据,代谢物组学和蛋白质组学的实验数据,和一些可产生基因、化学品列表的小规模实验的数据,得到可靠的深入的分析结果,从而实现“精准医疗”。

 

本次培训主要针对进行各种组学研究的科研工作者,讲解基于这些组学数据进行的IPA生物通路分析,能得到什么样的分析结果,以及怎样基于这些分析结果来帮助我们深入地解释各种组学数据。操作培训包括查询功能、数据上传,以及分析结果讲解等。

 

授课安排

授课内容以实际为准,时间为上午 900 -1200,下午1300 - 1630

日期

授课题目

授课内容

1210

(第一天)

IPAIngenuity知识库概述

特邀报告一:Systems-Biology Approaches to Drug Discovery and Developement(系统生物学导引药物研发)

报告人:李英雄 教授 中国台湾

特邀报告二:An Overview of IPAIPA概述)

IPA简介、功能与应用、介绍Ingenuity强大的知识库

IPA数据管理与查询功能

1.        IPA操作界面与基本操作

2.        数据文件格式与导入

3.        Ingenuity知识库查询

4.        基因/蛋白相关知识背景与通路查询、数据过滤、精炼与知识挖掘

5.        疾病相关基因/蛋白/药物等数据与文献查询

1211

(第二天)

核心分析与分子网络

1.        创建新的核心分析项目(Core Analysis

2.        鉴定数据中的作用方向与生物学效应

3.        预测上游调节因子

4.        分子互作网络构建与分析

对比分析及其它

1.        创建对比分析(Comparison Analysis

2.        深入检验多组学平台、多时间点、多试验组别差异分析

3.        IPAIngenuity知识库高级功能使用

4.        IPA项目管理与数据共享

1212

(第三天)

IPA应用案例

1.        IPA使用案例介绍

2.        实际案例与分析流程讲解

结业考试及专题讨论

1.        IPA技术与应用结业考试

2.        结业考试结果反馈与解答

3.        专题讨论

【讲师团队】

1李英雄 教授,中国台湾,现任中山医学大学讲座教授暨中山医学大学附属总院执行长,中国科学院客座研究员,曾任长庚大学医学院院长,中国医药大学副校长,北大等客座教授。

2QIAGEN Advanced Genomic Group Manager

3裴智勇 博士,北京市计算中心生物计算事业部技术总监,从事生物信息数据分析与专业软件应用工作,在国内发表基因组学、生物学通路、大分子相互作用相关的论文多篇,具有较丰富的生物学、医学数据处理与高性能计算机的运用、程序开发及数据挖掘经验。

4闫鹏程 博士,北京市计算中心生物计算事业部副经理。研究方向主要集中在转录组测序、基因组测序和疾病基因组分析,以及海量数据的生物信息学分析平台构建等方面,在生物信息高性能计算领域有丰富经验。

报名费用】  

注册费: 3000/人(含听课费、资料费、上机费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。

【付费方式】 

现金、支票、银行转账、银行汇款

单位全称:北京市计算中心      

账号:0200151819100023937 

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部—您的姓名”,个人汇款请备注上单位名称)

【报名优惠政策】

11120日前报名成功并缴费每人可优惠300元(限非团报人员)。

2 4+1团报,可免费赠送一个名额 ;培训座位按收到报名表先后顺序安排。

3、参加培训的学员,可以获得IPA账号七天试用。

4、参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。

 联系信息

计算中心张老师  010-5934177118618295767,邮箱:zhangly@bcc.ac.cn   QQ2814500767

计算中心员老师  010-5934177318701529461,邮箱:yuanll@bcc.ac.cn

源资公司韩老师 021-3250438518665713605,邮箱:hanyingzi@tri-ibiotech.com.cn

源资公司周老师 010-6252101613811582314,邮箱:zhoumei@tri-ibiotech.com.cn QQ850933186

温馨提示:如果您对软件有兴趣,请直接咨询周老师联系购买事宜。

 

 

 

会议时间2015-12-10至2015-12-12
会议地点北京
主办单位源资信息科技(上海)有限公司
联系人韩老师
电话021-32504385
Emailhanyingzi@tri-ibiotech.com.cn
官方网址http://www.tri-ibiotech.com.cn/trainingnotice/n419.html

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