生物信息学分析实战演练
l 直接上机操作,手把手快速入门生物信息学分析
l 有效挖掘显著差异基因/蛋白的生物学含义
l 针对自有芯片数据,做生物通路富集分析,得到属于自己试验结果的生物通路网络
l 对比不同实验组的大数据,获得独一无二的差异表达结果
l 查询差异基因/蛋白的生物功能,寻找相关调控因子,直接靶向定位
l 规避数据中假阳性/假阴性数据,获得有效的生物学结果
主办单位:北京市计算中心生物计算事业部
源资信息科技(上海)有限公司
培训时间: 2015年12月10日-12日 (火热报名中)
培训地点:北京市计算中心三层会议室 (北京海淀区丰贤中路7号3号楼)
随着基因组序列测定的费用越来越低,收集一个人遗传信息的速度也越来越快,我们能够更好地检测预防疾病、个性化定制药物疗法,并对海量的医学研究数据进行个性化处理。这种技术上的进步会让大部分人长期保持健康,同时这种基因图谱和分析技术是一种新兴的医学专业,世人称之为“精准医疗”。
“精准医疗”时代的来临和大数据的爆发,如何有效利用大数据技术将队列数据、临床数据、组学数据、结构生物学数据、药物分子信息等数据进行挖掘和处理,通过生物信息学的手段发现新靶点、新结构、新药物、新方案、新标准和新规范是目前的首要任务。
Ingenuity Pathway Analysis (IPA) 基于后台高度结构化的Ingenuity Knowledge Base知识库,包括人工阅读提取的几百万条公开发表的科研成果和报告,可用于分析、整合、理解来自于基因表达,microRNA,SNP,RNA-Seq,SNP-Genotyping微阵列的数据,代谢物组学和蛋白质组学的实验数据,和一些可产生基因、化学品列表的小规模实验的数据,得到可靠的深入的分析结果,从而实现“精准医疗”。
本次培训主要针对进行各种组学研究的科研工作者,讲解基于这些组学数据进行的IPA生物通路分析,能得到什么样的分析结果,以及怎样基于这些分析结果来帮助我们深入地解释各种组学数据。操作培训包括查询功能、数据上传,以及分析结果讲解等。
【授课安排】
授课内容以实际为准,时间为上午 9:00 -12:00,下午13:00 - 16:30。
日期
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授课题目
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授课内容
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12月10日
(第一天)
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IPA与Ingenuity知识库概述
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特邀报告一:Systems-Biology Approaches to Drug Discovery and Developement(系统生物学导引药物研发)
报告人:李英雄 教授 中国台湾
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特邀报告二:An Overview of IPA(IPA概述)
IPA简介、功能与应用、介绍Ingenuity强大的知识库
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IPA数据管理与查询功能
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1. IPA操作界面与基本操作
2. 数据文件格式与导入
3. Ingenuity知识库查询
4. 基因/蛋白相关知识背景与通路查询、数据过滤、精炼与知识挖掘
5. 疾病相关基因/蛋白/药物等数据与文献查询
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12月11日
(第二天)
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核心分析与分子网络
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1. 创建新的核心分析项目(Core Analysis)
2. 鉴定数据中的作用方向与生物学效应
3. 预测上游调节因子
4. 分子互作网络构建与分析
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对比分析及其它
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1. 创建对比分析(Comparison Analysis)
2. 深入检验多组学平台、多时间点、多试验组别差异分析
3. IPA与Ingenuity知识库高级功能使用
4. IPA项目管理与数据共享
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12月12日
(第三天)
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IPA应用案例
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1. IPA使用案例介绍
2. 实际案例与分析流程讲解
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结业考试及专题讨论
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1. IPA技术与应用结业考试
2. 结业考试结果反馈与解答
3. 专题讨论
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【讲师团队】
1、李英雄 教授,中国台湾,现任中山医学大学讲座教授暨中山医学大学附属总院执行长,中国科学院客座研究员,曾任长庚大学医学院院长,中国医药大学副校长,北大等客座教授。
2、QIAGEN Advanced Genomic Group Manager
3、裴智勇 博士,北京市计算中心生物计算事业部技术总监,从事生物信息数据分析与专业软件应用工作,在国内发表基因组学、生物学通路、大分子相互作用相关的论文多篇,具有较丰富的生物学、医学数据处理与高性能计算机的运用、程序开发及数据挖掘经验。
4、闫鹏程 博士,北京市计算中心生物计算事业部副经理。研究方向主要集中在转录组测序、基因组测序和疾病基因组分析,以及海量数据的生物信息学分析平台构建等方面,在生物信息高性能计算领域有丰富经验。
【报名费用】
注册费: 3000元/人(含听课费、资料费、上机费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用),主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。
【付费方式】
现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心
账号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部—您的姓名”,个人汇款请备注上单位名称)
【报名优惠政策】
1、11月20日前报名成功并缴费每人可优惠300元(限非团报人员)。
2、 4+1团报,可免费赠送一个名额 ;培训座位按收到报名表先后顺序安排。
3、参加培训的学员,可以获得IPA账号七天试用。
4、参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
【联系信息】
计算中心张老师 010-59341771,18618295767,邮箱:zhangly@bcc.ac.cn QQ:2814500767
计算中心员老师 010-59341773,18701529461,邮箱:yuanll@bcc.ac.cn
源资公司韩老师 021-32504385,18665713605,邮箱:hanyingzi@tri-ibiotech.com.cn
源资公司周老师 010-62521016,13811582314,邮箱:zhoumei@tri-ibiotech.com.cn QQ:850933186
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