生物数据分析实战2015系列讲座

发布时间:2015-03-17 10:51:29

 第一期分子进化分析培训班---春季培训开始接受报名,本期讲座的主要内容以实际案例上机为主,讲解各种分子进化数据的实用分析和图表绘制方法。特邀讲师包括SCI杂志审稿人在内,在分子进化方向皆具备欧美十余年的科研项目经验,任职于复旦大学和华东师范大学。

第二期组学数据功能分析培训班---春季培训开始接受报名,本期讲座以实际案例上机为主,讲解各种组学数据的相互比较,功能分析的实用分析和图表绘制方法。特邀讲师包括SCI杂志审稿人在内,在生物信息及分子动力方向皆具备欧美十余年的科研项目经验,任职于复旦大学和华东师范大学。培训旨在通过实践学习多种组学数据的分析方法,解读生物学意义以及SCI论文释疑。

承办单位

金弗康生物科技(上海)有限公司

时间、地点

培训时间:第一期分子进化分析培训班:201549日(周四)至411日(周六);

第二期组学数据功能分析培训班:2015416日(周四)至418日(周六)

培训地点:上海格林豪泰大酒店(沈杜公路店)

报名链接:http://www.geneforhealth.com/col.jsp?id=116

 

分子进化分析培训班(49-11日)

日期

时间

授课题目

授课内容

49日(周四)

08:30-09:30 
1h

报到
开班仪式

安装软件
测试网络

09:30-11:30
2h

分子进化/生物信息分析内容/套路的详解

SCI文章为例,具体学习分子进化研究中流行的分析思路和方法

13:00-15:00 
2h

主流数据库使用 
上机实践

重点学习在NCBIUNIPROTENSEMBL网站中获取数据的方法和途径

 

15:00-17:30
2.5h

同源家族成员查找

上机实践

重点学习如何在数据库中查找已知序列的同源信息和数据的获取。

410日(周五)

09:30-11:30 
2h

同源家族成员比较分析

上机实践

在获取同源家族成员后进行相互比较,分析保守区域,获取重要功能位点,绘制sequence logo图。

13:00-17:00
4h

分子进化树构建

上机实践

学习分子进化树构建原理,MEGA软件的使用,对进化树的解读

 

 

 

17:00-17:30 
0.5h

总结答疑

 

411日(周六)

 

 

 

9:30-11:30
2h

基因功能注释

上机实践

学习GO,KEGG分析,绘制饼图,柱状图,通路图

13:00-15:00
2h

蛋白2D结构分析

信号肽,跨膜结构分析,二级结构预测,结构域分析

15:00-17:00
2h

蛋白3D结构分析

PDB数据库学习,3D结构模拟,绘图

17:00-17:30 
0.5h

总结答疑

 

 

 

 

 

第二期组学数据功能分析培训班(416 18号)

日期

时间

授课题目

授课内容

日期

 

416日(周四)

08:30-09:30 
1h

报到
开班仪式

安装软件
测试网络

9:30-11:30
2h

组学数据格式

1.  转录组学数据格式

2.  蛋白组学数据格式

13:00-14:00
1h

物种数据获取

重点学习在NCBIUNIPROTENSEMBL网站中获取数据的方法和途径

14:00-16:30
2.5h

数据准备

1.  归一化

2.  PCA分析

3.  聚类分析

4.  差异数据筛选

1630-1730
1h

SCI从撰写到投稿
SCI杂志审稿人主讲

SCI论文写作技巧,投稿和回复审稿人意见

日期

 

417日(周五)

 

单组数据分析

 

9:30-11:30
2h

GO富集分析

学习GO数据结构,分析方法,绘制发表格式图片

13:00-15:00
2h

KEGG信号通路富集分析

学习KEGG数据库的使用,学习解读KEGG信号通路图

绘制图片

15:00-16:30
1.5h

蛋白互作分析

学习蛋白互作数据库STRING的使用,数据获取

1630-1730
1h

共表达分析

学习计算pearson相关性,分析,聚类和绘图

日期

 

418日(周六)

 

多组数据分析

包括多种处理,多个时间点

9:30-11:30
2h

调控网络模型构建

1.  学习使用cytoscape进行简单模型构建

2.  学习在模型中整合富集结果(BP/KEGG)信息

13:00-15:00
2h

多组数据联合分析

学习使用韦恩对数据进行分组并绘图

15:00-16:30
1.5h

 

根据需要进行子集合并,再进行富集分析

合并子网络进行复杂调控模型构建

1630-1730
1h

答疑

 

 

 

 

会议时间2015-04-09至2015-04-18
会议地点上海
主办单位金弗康生物科技(上海)有限公司
联系人陈老师
电话02133938669
Emailyun.chen@geneforhealth.cn
会议规模51-100人
官方网址http://www.geneforhealth.com/col.jsp?id=116

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