10x Genomics单细胞转录组测序及多组学数据挖掘技术

发布时间:2019-06-17 10:19:07

 

10x Genomics单细胞转录组测序及多组学数据挖掘技术培训班

 

转录组学数据泛滥的时代,如何才能找到数据中的亮点,如何深度挖掘数据中隐藏的创新点,让科研工作者掌握几种深度解析组学数据的方法。本课程一共3天,全部课程均理论与实战结合。从LinuxR基础、分析平台搭建、SCI论文图表整理、多组学分析思路、常规转录组及单细胞转录组分析标准流程、差异基因分析、功能富集分析、流程优化。主讲专家来自重点高校及科研院所一线科研人员,长期从事生物数据分析与挖掘,基因测序等领域工作研究工作,以第一作者发表过多篇生物学一区、二区TOP  SCI论文(如:Plos Genetics; Plant Cell等)精通python语言、R语言等分析工具,具有丰富的科研及高通量测序数据分析与挖掘经验,培训学员近2000人。

主办单位:北京市计算中心 
协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室 

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心 

工信部和信息化人才培养工程培训基地
中国生物工程杂志 

举 办 地:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

课程安排:

201982-4

 

主题

简介

第一天 (理论+实操)

10X Genomics 单细胞转录组测序技术、单细胞悬浮液或原生质体制备技术

 

1、 基因组、生物信息学相关的背景概述

2、10X Genomics 单细胞转录组测序技术简介

3、单细胞悬浮液或原生质体制备技术

4、上机操作基础(R语言实操、Linux服务器架构及基本操作

第二天(理论+实操)

单细胞转录组测序技术分析流程(常规分析及高级分析流程介绍及深度解析)

 

1、  Cell ranger 质控

2、 T-SNE聚类

3、 如何确定细胞类群

4、如何寻找bio-marker

5、如何优化分析流程

第三天 (理论+实操)

多组学数据深度挖掘、结果展示技巧及高分SCI论文整理思路

 

 

 

1、多组学研究思路

2、 多种作图方式结合

(综合利用RPPT等绘图工具拼接完成论文图片)

3、高分辨率SCI论文图片生成

n  (综合利用AIpdfviewer生成高质量论文图片)

n  数据重复性评估

(如何在文中体现出不同重复的RNA-SEQ结果、Realtime PCR结果与RNA-SEQ结果如何对用)

n  基因共表达网络构建与Cytoscape展示

n  多组数据表达趋势聚类及深度解析策略

注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
【收费标准】 注册费:3900/人,包括学费、资料费、上机费、午餐费。
材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。培训期间可免费提供工作餐。
【报名优惠政策】
1
7.15日前报名并缴费的学员每人可减少200
2
3人以上团体报名每人可减少300元;
3
4+1团报,可免费赠送一个名额;                
4
、 上面几种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。

老学员参加及老学员推荐参加均可额外优惠200元。
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。
【请联系】QQ号:2814500767邮箱:bcc-sxpx@bcc.ac.cn
徐老师  010-5934178615801436028(微信同号)

员老师 010-5934177318701529461(微信同号) 

【付费方式】  现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心
    号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(备注:在汇款明细里加上“生物计算事业部——您的姓名”)

【注】开课前一周会发送邮件通知,若未接到邮件通知,请电话咨询

 

会议时间2019-08-02至2019-08-04
会议地点北京海淀区
主办单位北京市计算中心
联系人员老师
电话18701529461
Emailyuanll@bcc.ac.cn

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