生物数据解读与分析实践研习会

发布时间:2019-03-27 11:08:49

主讲专家

伦永志,男,教授,博士,博士后,硕士生导师,壶兰学者,福建省高等学校新世纪优秀人才。从事本科、研究生教学多年并在二十余期培训会议中取得了极高的教学评价,受到广大学员的一致好评和推崇。

 

课程大纲

 

426

08:30-09:00

软件安装

 

09:00-12:00

核酸信息注释

NCBI数据库:Gene(参考序列)、Unigene(标准参考序列)、Nucleotide(非参考序列)子数据库。

EBI数据库:HGNC(标准全称/缩写识别、转换)、Expression Atlas(表达图谱)子数据库。

14:00-15:30

核酸信息注释

基因结构数据库:内含子剪切位点、启动子序列及分析策略、转录因子及其结合位点。

15:30-17:30

蛋白质信息注释

蛋白质序列数据库:UniProt数据库。

蛋白质相互作用数据库:String数据库。

蛋白质三级结构数据库:PDB数据库。

功能注释数据库:GOKEGG数据库。

427

09:00-12:00

非编码RNA信息注释及靶点分析

非编码RNA注释、靶点预测、验证靶点、功能及疾病关联等数据库。

1. miRNAmiRBaseTargetScanmiRTarBasemiRPathmiRDB等数据库。

2. lncRNANONCODELNCipedialncRNAdbLncBase等数据库。

3. circRNAcircBasestarBaseCircInteractome等数据库。

14:00-17:30

表达数据挖掘与聚类

利用GEO2R在线工具筛选获得差异表达基因集,并获得TCGA数据库交集结果。

先利用ArrayTools软件处理GEO数据库下载的表达谱数据,再进行聚类分析。

428

09:00-12:00

基因集差异共表达分析

基因集差异共表达分析策略。

利用DAVID在线工具进行基因集功能富集分析(GO MFBPCCKEGG Pathway)。

绘制基因集功能富集图/维恩图。

基因集相互作用图形化分析。

13:00-15:00

交互作用数据可视化

利用Cytoscape软件进行关联基因注释、分子间相互作用、基因集差异表达、基因集共表达的可视化。

可视化结果的保存与输出。

注册费用:

注册费用:3500元(报名费、注册费、资料费、会议费、午餐费等)食宿可统一安排,费用自理。

 

发票开具类型:培训费、会议费、资料费,授课期间发放纸质邀请函(盖章)和发票。

温故而知新:

 

参加此次实训会的学员,另外赠送一次学习巩固机会,本人可凭有效代表证件,再次免注册费参加相同课程一次;

生物数据解读与分析实践研习会--广州.doc

 

会议时间2019-04-25至2019-04-28
会议地点广东广州
主办单位郑州晟智科信教育培训中心
联系人杨敏
电话15838342318
Emailszkxym2016@126.com

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