主讲专家
伦永志,男,教授,博士,博士后,硕士生导师,壶兰学者,福建省高等学校新世纪优秀人才。从事本科、研究生教学多年并在二十余期培训会议中取得了极高的教学评价,受到广大学员的一致好评和推崇。
课程大纲
4月26日
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08:30-09:00
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软件安装
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09:00-12:00
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核酸信息注释
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l NCBI数据库:Gene(参考序列)、Unigene(标准参考序列)、Nucleotide(非参考序列)子数据库。
l EBI数据库:HGNC(标准全称/缩写识别、转换)、Expression Atlas(表达图谱)子数据库。
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14:00-15:30
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核酸信息注释
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l 基因结构数据库:内含子剪切位点、启动子序列及分析策略、转录因子及其结合位点。
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15:30-17:30
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蛋白质信息注释
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l 蛋白质序列数据库:UniProt数据库。
l 蛋白质相互作用数据库:String数据库。
l 蛋白质三级结构数据库:PDB数据库。
l 功能注释数据库:GO、KEGG数据库。
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4月27日
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09:00-12:00
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非编码RNA信息注释及靶点分析
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l 非编码RNA注释、靶点预测、验证靶点、功能及疾病关联等数据库。
1. miRNA:miRBase、TargetScan、miRTarBase、miRPath、miRDB等数据库。
2. lncRNA:NONCODE、LNCipedia、lncRNAdb、LncBase等数据库。
3. circRNA:circBase、starBase、CircInteractome等数据库。
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14:00-17:30
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表达数据挖掘与聚类
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l 利用GEO2R在线工具筛选获得差异表达基因集,并获得TCGA数据库交集结果。
l 先利用ArrayTools软件处理GEO数据库下载的表达谱数据,再进行聚类分析。
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4月28日
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09:00-12:00
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基因集差异共表达分析
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l 基因集差异共表达分析策略。
l 利用DAVID在线工具进行基因集功能富集分析(GO MF、BP、CC;KEGG Pathway)。
l 绘制基因集功能富集图/维恩图。
l 基因集相互作用图形化分析。
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13:00-15:00
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交互作用数据可视化
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l 利用Cytoscape软件进行关联基因注释、分子间相互作用、基因集差异表达、基因集共表达的可视化。
l 可视化结果的保存与输出。
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注册费用:
注册费用:3500元(报名费、注册费、资料费、会议费、午餐费等)食宿可统一安排,费用自理。
发票开具类型:培训费、会议费、资料费,授课期间发放纸质邀请函(盖章)和发票。
温故而知新:
参加此次实训会的学员,另外赠送一次学习巩固机会,本人可凭有效代表证件,再次免注册费参加相同课程一次;
生物数据解读与分析实践研习会--广州.doc
会议时间 | 2019-04-25至2019-04-28 |
会议地点 | 广东广州 |
主办单位 | 郑州晟智科信教育培训中心 |
联系人 | 杨敏 |
电话 | 15838342318 |
Email | szkxym2016@126.com |
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