浙江大学基因组科学(第56期)研习班通知

发布时间:2018-10-11 10:33:17

 

 

    数:56期  

间:20181116-23日(16日全天报到,17日起授课)

点:浙江杭州·浙江大学华家池校区

随着众多生物基因组测序项目的完成,生物学数据正在加速度增长。如何科学地分析和注释这些高通量数据,已成为生物学工作者急需学习和解决的问题。

浙江大学“基因组科学研习班”项目创始于200310月,由DNA双螺旋结构的发现者詹姆斯•杜威•沃森教授与浙江大学沃森研究院首任院长杨焕明教授共同创办,本期研习班邀请北京基因组所于军教授、胡松年教授为您讲授基因组学基础知识和前沿进展、二代测序等实验技术的关键事项;浙江大学杨军教授、陈铭教授、钟伯雄教授、徐建红教授等多位基因组领域大咖专家为你在高通量分析研究方法和思路方面答疑解惑。

 

本研习班四次荣获浙江大学优秀项目创新奖,一次入选浙江大学国家级专业技术人员继续教育基地重点扶持项目,已累计举办55期,学员遍布全国,累计培训学员5800余名。每期均不乏教授、博导参加培训,更受到博士后、硕博生等年轻学者的青睐。他们中有一些带着课题或技术问题前来交流和联系,不少学员通过本研习班建立了长期协作关系,共同申请国家重大研究计划项目、国家自然科学基金等,共同发表论文,其中不少优秀的研究成果,已在SCI期刊上发表。

一、培训班上课内容、

上课内容涵盖基因组学蛋白质组学系统生物学的研究方法、技术思路、前沿进展及其在各生物学科中的应用。

核心课程包括:

1. 基因组的比较研究、DNA测序技术原理与进展(于军 教授)

2. 转录组的测定与分析、大规模测序方法及应用、微生物基因组学、基因组学与精准医学(胡松年教授)

3. 系统生物学导论及高通量分析技术应用(杨军 教授)

4. 系统生物学建模分析(陈铭 教授)

5. 蛋白质组学概论及应用 (钟伯雄 教授)

6. 基因组学在医学中的应用(祁鸣 教授)

二、培训班上机内容

本研习班上机实习课采用跟我学方式,学习实践各类基础生物信息学软件,每人一台PC机跟着大屏幕一步步学会基因组、蛋白质组学数据分析的基本方法。

主要内容如下:

实习一: 基因组数据注释和功能分析

通过序列比对工具BLAST的学习,了解基因功能注释的原理;介绍多序列联配工具ClustalX及分子进化分析软件MEGA4,掌握系统发生树绘制的基本方法,认识基因复制在进化上的功能;学习基因序列分析常用的数据库和软件。 

实习二: 转录组数据分析

介绍转录组数据分析的基本流程及其原理;通过对tophatcufflinksR等转录组数据分析工具的介绍及演示,了解基于二代测序数据的转录组分析流程及常用分析方法; 利用keggGOstatDAVID等在线工具挖掘转录组数据的生物学意义。

实习:蛋白质结构与功能分析

 从数据库搜索感兴趣的蛋白质氨基酸序列开始,接着对蛋白质基本理化性质、二级结构、和三维空间结构和序列模体进行分析,预测目标蛋白的生物功能。

实习蛋白质组学数据分析

使用XTandemMascotSequest等软件鉴定蛋白质质谱数据,将质谱结果匹配到蛋白质组数据库鉴定蛋白;使用TPP软件包进行统计学分析和优化检索结果练习。

实习:系统生物学软件实习-----网络结构显示与分析

利用Cytoscape系统生物学分析软件,分析蛋白-蛋白相互作用,展示分子网络系统,并与基因表达等数据整合。

三、培训对象

1. 无生物信息学背景,希望了解生物信息学的学员;

2. 计划开展各类组学研究的科研人员;

3. 已有组学数据需了解分析方法的研究人员;

4. 有志从事生物信息学相关工作的学生或者技术人员。

四、报名方法

      若有参加意向,请直接将回执发至genetrain@zju.edu.cn,我们会回函并在浙江大学继续教育系统录入,待排定课表后发给您详细课程表。待您再次确认后,发给您报到通知并排定上机号。培训结束,发放浙江大学继续教育证书。

五、教材(会务组提供)

DNA和蛋白质序列数据分析工具(第三版)薛庆中等编著,科学出版社


 

六、其他事项

收费标准:注册费为3800/人(可转账、现金、刷卡【含公务卡】)。

食宿可统一安排,费用自理。

人:代成林 18757558672      咨询电话:0571-88206579
电子邮件地址:
genetrain@zju.edu.cn daichenglin@zju.edu.cn

因本课程天数较多报名学员因故缺席部分课程可联系会务组在后续培训班中免费旁听

点击下载:报名表.xlsx

 

会议时间2018-11-16至2018-11-23
会议地点杭州

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