2017年11月 重庆 表观遗传、DNA甲基化、组蛋白

发布时间:2017-11-02 11:52:17

 一、培训特色

 主题明确,针对性强,理论和实践结合,主讲与学员研讨的方式进行;

 授课专家拥有丰富的表观遗传学数据分析和项目执行经验;

 课下主讲老师为您所遇到的问题提供个性化解答;

 配合研究中所需的要点,围绕实际研究中常用的软件展开;

 学员通过与专家直接交流,能够分享到顶尖学术机构的研究经验和实验设计思路。

 

培训内容

 、表观遗传学研究现状及未来发展

 、表观遗传学相关的数据库介绍与使用

 三、高通量测序技术概述

 四、常用生物数据文件类型介绍与格式转换

 五、代测序数据质控、比对分析与可视化

 六、常用在线工具和数据库使用操作

 一、DNA甲基化原理、应用及研究方法、微生物基因组

    1甲基化特异性的PCRMethylation-specific PCRMSP

    2亚硫酸氢盐测序法(Bisulfite sequencing PCRBSP

    3 高分辨率熔解曲线法(High Resolution MeltingHRM

4.比较各项甲基化研究方法存在的优缺点等

 

二、DNA甲基化数据分析策略

    1 WGBS分析:利用fastqcperl脚本对原始数据进行质控

    2 之后用bismark进行mappingbeta值计算

    3 RmethylKit包筛选差异甲基化位点并用pheatmap包和ggplot2包进行可视化

   4.PeakAnnotator对 这些位点进行功能域和基因注释,最后用DAVID进行GOKEGG 通路注释

DNA甲基化调控案例讲解

DNA甲基化测序数据分析上机实战

 

三、DNA甲基化芯片数据分析上机实战

    1芯片DNA甲基化分析

    2利用RIMA包进行差异甲基化位点鉴定并用pheatmap包和ggplot2包进行可  视化, 用DAVID进行GOKEGG通路注释

 一、染色质可及性测序技术

 二、组蛋白修饰原理与分子功能

 三、组蛋白修饰功能

 四、核小体定位图谱分析实战练习

 五、组蛋白修饰数据分析实战练习一

 六、组蛋白修饰数据分析实战练习二  

 一、还原真实染色,质构象--HiC技术

 二、TCGAICGC,数据库介绍与使用

 三、干细胞的表观遗传学研究

 四、转录因子ChIP-seq数据分析

 五、生存曲线分析

非编码RNA研究及数据分析

1.  miRNA研究的综合解决方案;
2miRNA研究的数据分析(芯片、测序);
3lncRNA研究的综合解决方案; 
4lncRNA研究的数据分析(芯片、测序); 
5Agilent相关技术在非编码RNA研究中的应用。

 

 

 

报名办法及费用 

每人3900(含报名费、培训费、资料费等相关费用不含食宿费用,食宿统一安排费用自理。

 

联系方式:

联系人:张爱国

联系电话:136 8311 1214

座机:010-58032788

报名邮箱:zky_im@vip.126.com

参会报名表.docx

会议时间2017-11-24至2017-11-27
会议地点重庆巴南区
主办单位中科云畅应用技术研究院
联系人张爱国
电话13683111214
Email3173746463@qq.com
会议规模11-30人

声明:

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