功能基因组、长非编码RNA、表观遗传学 培训班

              2017.8.18——8.21 功能基因组、长非编码RNA、表观遗传学 培训班

   本期培训班有着丰富的内容，前沿科研技术，培训班中包括了非编码RNA 的功能研究策略与科研设计，研究关键技术等，涵盖长链非编码RNA、小分子RNA与表观遗传学的完整解决方案，理论讲解和实验操作结合，让你更快更好地掌握时下科研技术与科研方向。

培训内容：

一、DNA测序技术-原理及技术

a)第二代测序技术：Illumina，454, Ion Torrent原理

b)第三代测序技术：PacBio, Hellicos原理

c)第四代测序技术：Oxford NanoPore原理

d)Hybridization based methods

e)测序技术的比较及展望 

二、基因组编辑技术（CRIPR技术）

a)不同基因组编辑技术的比较Meganuclease，ZFN，TALEN，          

b)CRISPR-Cas9

c)CRISPR-Cas系统的作用机理

d)CRISPR-Cas系统在基因组编辑中的应用

e)CRISPR-Cas系统的其他应用

三、生物信息学基本实验技能

a)Linux常用命令 

b)EMBOSS，经典序列分析工具集

c)Perl编程基础

四、小RNA（microRNA）研究方法及案例

a)实验流程

b)数据处理比对

c)靶基因富集分析

d )miRNA-mRNA关联分析

e)主要工具包的使用：miRDeep，mirDeep*

五、长非编码RNA（lncRNA）研究方法及案例

a)实验流程

b)lncRNA的发现和分类

c) 功能分类

d)主要工具包的使用：lncRScan，LncRNAFunction等 

六、表观遗传学研究方法及案例

a )DNA methylation, MeDIP-seq

b )Histone modifications, ChIP-seq, ChIP-exo

c )Nucleosoem positioning and occupancy, MNase-seq

d )Chromatin accessibility, DNase-seq

e )3D chromatin structure, 3C, 4C, 5C, Hi-C

七、基于DNA/RNA测序技术的功能基因组学研究策略分析

a )ARNA Transcription: ChIRP-Seq, GRO-Seq, Ribo-Seq, CLIP-Seq

b )RNA structure: SHAPE-Seq, PARS-Seq, FRAG-Seq, CAP-seq

c )Low-level RNA detection: Quartz-Seq, DP-Seq, Smart-Seq, d 

d )Smart-Seq2

e )Low-level DNA detection: smMIP, MDA, MALBAC, OS-Seq

八、R语言基础

　a ） R和R studio的安装

　b ） 从bioconductor下载安装packages

　c ） R绘图基础，correlation matrix ,dot plot

    非编码RNA和表观遗传学是近年来生命科学领域的研究热点，非编码RNA在包括发育、免疫、生殖等基本生理过程中扮演了不可替代的角色，同时在包括多种重大疾病中也发挥重要作用。2016年，表观转录组分析（Epitranscriptome analysis）荣膺Nature Methods年度生命科学技术，目前已知的RNA修饰超过100种，其中很多修饰能参与到真核基因表达调控。非编码RNA和RNA表观遗传学的研究，将加深人类对生命系统复杂调控网的理解和认识，并为疾病的研究和治疗提供新的视角，有望从中发现新的分子标志物与治疗靶点。

报名须知：

1.注册费：4300元/人；（包括培训费、资料费、上机费、考试费等；食宿统一安排，费用自理） 

2.团体优惠：同一单位5位学员参加，可额外赠送1个免费名额； 

3.本次培训班共35个名额，培训座位按收到报名表先后顺序安排。

主办单位：中国科学院计算技术研究所 烟台分所

培训地点：山东大学 计算中心

培训时间：2017.8.18——8.21

联系人：张爱国

联系电话：13683111214

咨询电话：010-58032788

声明：