浙江大学基因组科学(第33期/总53期)研习班通知

发布时间:2017-09-12 10:58:41

 

总 期 数:53期

办 学 历 史:16年(2002年-2017年)

开 班 时 间:2017年11月17日-24日(17日为全天报到日,18日开始上课)

上 课 地 点:杭州 浙江大学华家池校区

  

随着众多生物基因组测序项目的完成,生物学数据正在加速度增长。如何科学地分析和注释这些高通量数据,已成为生物学工作者急需学习和解决的问题。

浙江大学基因组科学研习班邀请北京基因组所于军教授、胡松年教授为您讲授基因组学基础知识和前沿进展、基因转录组的测定及分析、二代测序等实验技术的关键事项;浙江大学杨军教授、陈铭教授等讲解系统生物学及高通量分析研究方法和思路。

研习班多次获得浙江大学优秀项目创新奖,目前已举办52期,学员来自全国30余个省市,累计培训学员5200余名。每次研习班不乏教授、博导参加,更受到博士后、硕博生等年轻学者的青睐。他们中有一些带着课题或问题前来交流和联系,不少学员通过研习班建立了长期协作关系,共同申请国家973863课题,共同发表论文,其中不少优秀的研究成果,已在SCI期刊上发表。

一、培训班上课内容
      上课内容涵盖基因组学蛋白质组学系统生物学的研究方法、技术思路、前沿进展及其在各生物学科中的应用。

核心课程包括

1. 基因组的比较研究、DNA测序技术原理与进展(讲课人:于 军 教授)

2. 转录组的测定分析、大规模测序方法及应用、微生物基因组学基因组学与精准医学(讲课人:胡松年教授)

3. 系统生物学建模分析及高通量分析技术应用(讲课人:杨军、陈铭教授等)

4. 蛋白质组学概论及应用 (讲课人:钟伯雄教授)

二、培训班上机内容
      上机实习课采用 跟我学方式,学习实践各类基础生物信息学软件,每人一台PC机跟着大屏幕一步步学会基因组、蛋白质组学数据分析的基本方法。

主要内容如下:

实习一: 基因组数据注释和功能分析
      通过序列比对工具BLAST的学习,了解基因功能注释的原理;介绍多序列联配工具ClustalX及分子进化分析软件MEGA4,掌握系统发生树绘制的基本方

法,认识基因复制在进化上的功能;学习基因序列分析常用的数据库和软件。

实习二: 转录组数据分析
      介绍转录组数据分析的基本流程及其原理;通过对tophatcufflinksR等转录组数据分析工具的介绍及演示,了解基于二代测序数据的转录组分析流程及

常用分析方法; 利用keggGOstatDAVID等在线工具挖掘转录组数据的生物学意义。

实习:系统生物学软件实习-----网络结构显示与分析
      利用Cytoscape系统生物学分析软件,分析蛋白-蛋白相互作用,展示分子网络系统,并与基因表达等数据整合。  

实习四:蛋白质结构与功能分析
      从数据库搜索感兴趣的蛋白质氨基酸序列开始,接着对蛋白质基本理化性质、二级结构、和三维空间结构和序列模体进行分析,预测目标蛋白的生物功

能。

实习五: 蛋白质组质谱分析
      使用XTandemMascotSequest等软件鉴定蛋白质质谱数据,将质谱结果匹配到蛋白质组数据库鉴定蛋白;使用TPP软件包进行统计学分析和优化

检索结果练习。

三、培训对象

1. 无生物信息学背景,希望了解生物信息学的学员;

2. 计划开展各类组学研究的科研人员;

3. 已有组学数据需了解分析方法的研究人员;

4. 有志从事生物信息学相关工作的学生或者技术人员。

四、报名方法
      有参加意向,直接将回执发至genetrain@zju.edu.cn,我们会即刻回函并在浙江大学继续教育系统录入,待排定课表后发给您详细程表。待您再次

确认后,发给您报到通知并排定上机号培训结束,发放浙江大学继续教育证书。(尚有少量名额,请尽快报名)

点击下载: 浙江大学基因组学研习班报名表.xlsx

五、教材(会务组提供

"DNA和蛋白质序列数据分析工具(第三版), 薛庆中等编著,

科学出版社出版 20126月发行。

 

 

 

 

 

"基因组学概论”(第二版),薛庆中等编著,科学 出版社

出版 2016年1月发行。

 

 

六、其他事项

收费标准:注册费为¥3800/人(可转账、现金、刷卡【含公务卡】)。

食宿可统一安排,费用自理。

人:代成林 18757558672      咨询电话:0571-88206579

电子邮件地址:genetrain@zju.edu.cn;daichenglin@zju.edu.cn

 

 

会议时间2017-11-17至2017-11-24
会议地点杭州

声明:

1.科学网会议频道仅负责发布会议信息,如需参会、汇款、获取邀请函或会议日程,请与主办单位联系
2.部分会议信息来自互联网,由于网络的不确定性,科学网对所发布的信息不承担真实性的鉴别工作,请谨慎选择汇款参会,若您发现信息有误,请联系010-62580811纠错
3.更多服务信息请点击这里
推荐会议