老师：
您好！
上海生咨生物科技有限公司盛情邀请您参加2014届生物信息学暑期研习班。本次研习班将在2014年7月22日至7月26日在上海举办。
本次研习班从基因组学（基因组高通量测序数据分析），转录组（RNAseq数据分析、miRNA数据分析、表达谱芯片分析）、蛋白质组（iTRAQ数据分析）、进化分析等多个方面讲解各种组学数据的分析方法。研习班将由多年从事生物信息学分析研究的科研专家和技术工程师共同授课，通过深入浅出的理论讲解和上机操作，帮助学员深入了解从基因组－转录组－蛋白质组的研究思路和数据分析方法，帮助学员拓展研究思路，掌握一些数据分析的方法。
本次研习班适合：
１） 零生物信息学知识但想要了解生物信息学的学员；
２） 正在或者将进行组学研究的科研人员；
３） 已有组学数据需了解分析方法的研究人员；
４） 想要将来从事生物信息学方向工作的学生或者工作人员。
主办单位：上海生咨生物科技有限公司
协办单位：上海产业技术研究院药物转化创新中心
支持单位：杭州谷禾信息技术有限公司
时间：2014年７月22日－2014年7月26日
地点：海荷欧风酒店，上海市闸北区共和新路1301号
课程安排：2014年7月22日-7月26日，报到时间2014年7月21日下午14:30- 17:30。
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时间
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课程内容
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注册
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7月21日 12:30 - 17:30
7月22日 8:30 - 9:30
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会议注册
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第一天(７月22日)
（基础知识和数据库）
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9:30-11:45
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生物信息学导论
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13:30-16:45
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Linux基础和软件安装
常用数据资源介绍（NCBI、 UCSC、ＵniProt等介绍）
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第二天(７月2３日)
（基因组测序数据分析）
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9:30-16:45
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基因组组装策略及方法
三代pacbio测序数据分析
基因组重测序及数据分析
微生物基因组功能注释
真菌基因组功能注释
上机操作：tablet,snpeff,velvet,BWA,
samtools， annovar，GATK等
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第三天(７月2４日)
（转录组测序数据分析）
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9:30-16:45
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RNAseq数据分析
miRNA数据分析
上机操作：BWA,samtools,cufflinks等
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第四天(７月2５日)
（进化分析和基因芯片）
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9:30-16:45
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进化分析
上机操作(clustalx,MEGA, phylip, Mrbayes等)
基于表达谱芯片的临床数据分析
基因表达谱芯片数据分析及其基本处理流程
（上机操作：Ｒ分析）
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第五天 (７月2６日)
（蛋白质组）
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9:30-16:45
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蛋白质鉴定和质量控制
提高蛋白鉴定覆盖度
蛋白质搜库上机
蛋白质组数据分析（ＧＯ功能分类和富集分析
通路分析，网络构建）
上机操作：DAVID， Cytoscape+ BiNGO， GSEA, CateGOrizer，Cluster+Treeview，Mev，MotifX等。
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注：1.课程具体安排以报名当天的课程表为准。
2.应需要上机练习，请携带笔记本电脑，建议配置为4G内存，10Ｇ空余硬盘空间。
收费标准
工作人员4600元/人，在校学生4100元/人 (含资料费和中餐)
其他优惠：
1. 同一单位2人以上参加蛋白质组学前沿技术研习班，每人优惠200元。
2. 2014年７月５日之前汇款优惠200元，以汇款回执时间为准。
3. 上海生咨生物科技有限公司的客户或之前参加过研讨班学员推荐学员优惠300元。
以上优惠可同时享受。
交通住宿费用自理，住宿预定需提前一周预定。
住宿协议酒店为海荷欧风酒店(准四星酒店)
协议价：豪华标准房280元/天（含双早）。注：合住每人140元/天，若凑不到合住的学员需支侍全价。
豪华大床房280元/天（含双早）。
名额有限，提前汇款学员可优先选择前排座位，报名后因有事无法参加的学员请提前１周联系我们。
付款方式：
1． 汇款至 上海生咨生物科技有限公司
开户银行：中国农业银行上海星火支行
汇款帐号：03805500040008016
请在汇款前与我们电话联系，汇款后将回单电子邮件发给我们，以便我们确认，汇款请注明“会议”+您的姓名。
联系人：
手机： 189－1780－5836 座机：021-31131531
QQ: 1377122204
备用联系人：
手机：159-0076-6827
2． 研习班报到当天现金支付。
讲课专家信息
李亦学 教授
上海生物信息技术研究中心主任，中科院上海生命科学研究院系统生物学重点实验室副主任，研究员，博士生导师。上海生物信息学会理事长，中科院“十一五”信息化专家组专家。曾任国家中长期发展规划第十五专题组副组长，上海市2002年科学预见专家，中国科学院计划局生命科学领域战略发展专家组专家，国家“十五” 863计划生物和农业技术领域生物信息技术主题专家组组长，国家科技部中英E-Science国际合作计划中方协调人。研究方向：蛋白质组学研究，系统生物学研究。
蔡晓辉 副研究员
中国科学院上海生化细胞所获生物信息学博士学位，毕业后先后在美国印第安娜大学计算生物学和生物信息学中心，加州大学圣地亚哥分校生物系统研究中心作为访问学者从事博士后工作。2011年至今在上海生物信息技术研究中心任副研究员工作。研究方向包括蛋白质序列、结构与功能关系，蛋白质重要功能位点的识别，蛋白质组学数据分析以及二代测序数据分析，生物信息学数据库和生物信息学算法开发等。
贾佳
新加坡海归生物信息学博士 上海生物信息技术研究中心副研究员，生命科学数据中心负责人，主要从事生物医药信息数据资源开发和整合技术的研究。
金谷雷
浙江大学生物信息学博士 杭州谷禾信息技术有限公司 总经理 从事生物信息研究近10年，参与了包括国家973、863计划以及自然科学基金等项目。研究阶段独立研发了Biopubinfo知识网络平台。擅长高通量测序数据分析。
徐昊
2001年起从事生物信息学数据分析工作，同济大学生物工程硕士，分别在华大基因、上海生物信息技术研究中心、众信生物技术有限公司担任数据分析工程师职务，曾获得国家杰出科学家证书。曾经担任过超过10期生物信息学培训班讲师，有丰富的培训经验。熟悉常用数据库以及分析软件，生物信息学擅长分析领域为RNA-seq、微生物基因组分析，分析超过百个cDNA文库和RNA-seq库，对金黄色葡萄球菌，钩端螺旋体、黄单胞菌等做过深入分析。
于复东 博士、副研究员。
2008年1月毕业于中国科学院上海生命科学研究院，获生物信息学博士学位。毕业后一直从事二代测序等高通量数据分析、肿瘤基因组学、及相关数据库开发和分析平台建立等生物信息学研究工作。目前主要从事肿瘤基因组学方面的研究工作，运用系统生物学的方法研究可以应用于临床早期诊断、预后、复发和转移相关的分子标志物基因及其功能等。近年来作为项目负责人完成了国家自然科学基金、上海市博士后基金、上海市白玉兰科技人才基金各一项，作为生物信息学分析平台负责人完成传染病重大专项课题一项，作为技术骨干参与完成863计划项目一项，累积发表SCI论文十余篇。
俞鸿
现任上海生咨生物科技有限公司经理，资深生物信息学工程师. 具有超过10年生物信息学分析经验。参与了水稻基因组、家蚕基因组、人肝蛋白质组计划以及其他的国家973、863计划及国家自然科学基金等项目。主要从事蛋白质组、基因组方向的分析、
会议地点及交通路线：
培训地点： 海荷欧风酒店，共和新路1130号
上海虹桥机场（二号航站楼）距离酒店30公里；乘出租车约40分钟，约80元可到酒店。坐2号地铁到人民广场换1号线到中山北路站下。
上海浦东国际机场距离酒店44.17公里；乘出租车约45分钟，约160元可到酒店。坐2号地铁到人民广场换1号线到中山北路站下。
上海火车站距离酒店2公里；乘出租车约5分钟，约14元可到酒店。地铁坐1号线到中山北路站下。
上海火车南站距离酒店20公里；乘出租车约30分钟，约60元可到酒店。地铁坐1号线到中山北路站下。
附件：2014届生物信息学暑期研习班回执表.doc
| 会议时间 | 2014-07-22至2014-07-26 |
| 会议地点 | 上海 |
| 联系人 | 许丹丹 |
| 电话 | 189－1780－5836 座机：021-31131531 |
| Email | ddxu@biorefer.com; 1377122204@qq.com |
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